Bioquímica: Glícidos, Lípidos, Proteínas e Ácidos Nucleicos
pH = -log[H3O+]
HCO3- + H3O+ = H2CO3 + H2O = CO2 + 2H2O
Acidifica á dereita, basifica á esquerda.
Glícidos
Os glícidos (hidratos de carbono) son compostos formados por carbono, hidróxeno e osíxeno. Clasifícanse en monosacáridos (por exemplo, o gliceraldehído e a dihidroxiacetona), disacáridos e polisacáridos.
Polisacáridos
Amidón: reserva vexetal formada por amilosa (aproximadamente 20 %, unións α-1,4) e amilopectina (aproximadamente 80 %, unións α-1,4 e ramificacións α-1,6 cada 24-30 unidades).
Glicóxeno: reserva animal, abundante no fígado e no músculo; posúe unións α-1,4 e ramificacións α-1,6 cada 8-12 unidades.
Heteropolisacáridos
Están formados por monómeros diferentes:
- Hemicelulosas: compoñentes da parede celular vexetal, formadas por glicosa, galactosa e fucosa.
- Pectinas: formadas por ácido galacturónico con unións α-1,4; presentes na lámina media dos tecidos vexetais.
- Agar-agar: derivado de algas, empregado como espesante e en cultivos de microorganismos.
- Glicosaminoglicanos (mucopolisacáridos): formados por ácido glicurónico e N-acetilglicosamina ou N-acetilgalactosamina. Son substancias intercelulares que dan consistencia ao tecido conxuntivo. Exemplos:
- Condroitina: ácido glicurónico e N-acetilgalactosamina; presente no cartílago.
- Ácido hialurónico: lubrica as articulacións e forma parte do humor vítreo.
- Heparina: presente nos pulmóns, no fígado e na pel; actúa como anticoagulante.
Heterósidos: glicolípidos e glicoproteínas
Mucoproteínas (mucinas): grande fracción glícida; atópanse nas vías respiratorias e urinarias e en secrecións dixestivas, onde lubrican e impiden infeccións.
Glicoproteínas: presentes na leite, nos anticorpos do sangue e nas estruturas da membrana plasmática, participando no recoñecemento celular.
Peptidoglicanos ou mureínas: compoñente ríxido das paredes bacterianas.
Lípidos
Son pouco ou nada solubles en auga, hidrófobos, untuosos e pouco densos. Proporcionan moita enerxía.
Funcións dos lípidos
- Enerxética: reserva de enerxía.
- Transporte: de substancias liposolubles.
- Illante e protectora: en tecidos e órganos.
- Estrutural: forman as membranas biolóxicas.
- Absorción de enerxía, vitaminas e hormonas.
Tipos de lípidos
Ácidos graxos: son anfipáticos. Canto máis longa é a cadea, maior é a temperatura de fusión e menor a solubilidade. Poden estar esterificados ou ser saponificables.
Terpenos: non son ácidos graxos; teñen estrutura lineal ou cíclica e son moi abundantes nos vexetais. Derivan do isopreno: monoterpenos (2 unidades, esencias), sesquiterpenos (3), diterpenos (4, como o fitol, que forma parte da clorofila), triterpenos (6, como a vitamina E, a K e o escualeno, precursor do colesterol) e tetraterpenos (8, carotenoides, pigmentos vexetais). Os carotenoides divídense en xantofilas (amarelas) e carotenos (laranxas); o β-caroteno é precursor da vitamina A. O poliisopreno dá lugar ao caucho.
Esteroides:
- Vitamina D: regula o metabolismo do calcio e do fósforo. Existen dous tipos: D2, obtida do ergosterol, e D3, obtida do colesterol. A súa carencia provoca raquitismo e osteomalacia.
- Ácidos biliares: fórmanse no fígado a partir do colesterol (por exemplo, o ácido cólico). Constitúen a bile, que emulsiona as graxas.
- Hormonas esteroides: derivan do colesterol.
- Adrenocorticais: formadas na codia das glándulas suprarrenais. A aldosterona regula o funcionamento do ril; o cortisol regula o metabolismo da glicosa.
- Hormonas sexuais: regulan o funcionamento dos órganos sexuais e a aparición dos caracteres sexuais secundarios (testosterona, estróxenos).
Prostaglandinas: derivan da ciclación de ácidos graxos insaturados de 20 C, como o ácido araquidónico. Regulan o metabolismo, a contracción do músculo liso, a inflamación, a mucosidade e a agregación plaquetaria.
Aminoácidos e proteínas
Aminoácidos: compostos orgánicos sinxelos, de baixa masa molecular, solubles en auga, cristalizables, incoloros e de punto de fusión elevado. Son anfóteros (zwitteriónicos) e presentan estereoisomería ópticaa.
Funcións das proteínas
- Estrutural: a nivel celular, glicoproteínas da membrana, histonas (cromosomas), tubulina e actina (citoesqueleto, cilios e flaxelos); a nivel orgánico, colaxeno e elastina.
- Transporte: permeasas e bombas (proteínas da membrana que transportan moléculas dun lado a outro), citocromos (transportan electróns), hemoglobina e hemocianina (osíxeno en vertebrados e invertebrados), mioglobina (osíxeno no músculo) e lipoproteínas (lípidos insolubles).
- Reserva: ovoalbúmina do ovo, caseína do leite.
- Homeostática: mantemento do equilibrio osmótico e do pH.
- Defensiva: inmunoglobulinas, trombina e fibrinóxeno (coagulación), mucinas bactericidas no tracto dixestivo e respiratorio.
- Hormonal: insulina (regula a glicemia), somatotropina (crecemento dos ósos e cartilaxes).
- Contráctil: confire ao organismo a capacidade de moverse e cambiar de forma. Actina e miosina forman as miofibrillas do músculo; a dineína move os cilios e os flaxelos.
- Catalizadora: os enzimas.
Clasificación das proteínas
Holoproteínas (globulares):
- Albuminas: solubles en auga, transportan moléculas e serven de reserva de aminoácidos (seroalbúmina do plasma, ovoalbúmina, lactoalbúmina).
- Globulinas: solubles en disolucións salinas (seroglobulinas do sangue, parte dos anticorpos, lactoglobulina, ovoglobulina).
- Histonas e protaminas: solubles en auga, ricas en aminoácidos básicos; asócianse co ADN para formar a cromatina.
- Prolaminas: insolubles en auga, presentes nas sementes vexetais.
- Gluteínas: insolubles en auga pero solubles en bases; presentes no trigo.
Holoproteínas fibrosas: colaxeno (tecido conxuntivo e cartilaxe), óso, queratina (epidermis, pelo, unllas), elastina (órganos que se deforman) e miosina e actina (músculo).
Heteroproteínas:
- Glicoproteínas: enlace covalente con glícidos. Exemplos: fibrinóxeno (coagulación), inmunoglobulinas, gonadotropinas (estimulan as gónadas), mucoproteínas (secrecións) e enzimas (ribonucleasa).
- Lipoproteínas: presentes nas membranas plasmáticas e no plasma sanguíneo (VLDL, LDL, HDL).
- Nucleoproteínas: formadas por ácidos nucleicos e proteínas (cromatina e ribosomas).
- Fosfoproteínas: por exemplo, a caseína e a vitelina.
- Cromoproteínas: pigmentos que teñen cor debido ao grupo prostético.
- Porfirínicas: grupo prostético metaloporfirina (anel tetrapirrólico e catión metálico), como a hemoglobina, a mioglobina e os citocromos.
- Non porfirínicas: conteñen cations metálicos pero non anel tetrapirrólico, como a hemocianina.
Especificidade dos enzimas
Os enzimas presentan especificidade de acción sobre o substrato: absoluta, de grupo ou estereoquímica.
ADN
Estrutura primaria
Secuencia de desoxirribonucleótidos dunha cadea, unidos por enlaces fosfodiéster. A cadea de ADN ten dous extremos libres: o 5′, unido a un grupo fosfato, e o 3′, unido a un grupo hidroxilo.
Estrutura secundaria
Disposición espacial en dobre hélice, coas bases enfrontadas unidas por enlaces de hidróxeno.
Deducción do modelo
Os datos experimentais de Erwin Chargaff, Rosalind Franklin e Maurice Wilkins permitiron establecer as seguintes conclusións:
- A densidade e a viscosidade das dispersións acuosas de ADN eran superiores ás esperadas, o que supuxo que as cadeas se unían mediante pontes de hidróxeno.
- Chargaff demostrou que as moléculas de pirimidinas e purinas aparecen en igual proporción (A = T e G = C).
- A difracción de raios X mostrou unha estrutura fibrilar de 20 Å de diámetro. Cada parella de nucleótidos está separada da seguinte por 3,4 Å, e cada volta da dobre hélice contén dez pares de nucleótidos, o que supón unha lonxitude de 34 Å por volta.
Modelo de dobre hélice (Watson e Crick)
- O ADN está formado por dúas cadeas de polinucleótidos enroladas arredor dun eixe, formando unha dobre hélice de 20 Å de diámetro.
- As bases nitroxenadas orientanse cara ao interior, paralelas ao eixe; os grupos hidrófobos quedan cara ao interior e establécense pontes de hidróxeno e interaccións hidrófobas entre elas.
- Cada volta contén 10 pares de nucleótidos, separados 34 Å entre si, e dá lugar a un surco maior e un surco menor.
- O enrolamento é dextrógiro e plectonémico, polo que non se poden separar as cadeas sen desenrolalas.
- As cadeas son antiparalelas e complementarias.
Variacións do modelo
- Forma B: a forma de Watson e Crick descrita anteriormente.
- Forma Z: dobre hélice levógira; cada volta contén 12 nucleótidos.
- Forma A: dobre hélice destrógira; as bases non son perpendiculares ao eixe, cada volta contén 11 nucleótidos e a lonxitude é de 28 Å.
ARN
O ARN ten a secuencia de aminoácidos codificada no ADN. Ten función de almacenamento e transmisión da información xenética. É unha molécula monocatenaria lineal que, en ocasións, forma horquillas; sintetízase no núcleo, copia a información xenética e lévaa ao ribosoma.
ARN mensaxeiro (ARNm)
- Eucariota: presenta zonas de dobre hélice e bucles; asociado a proteínas forma ribonucleoproteínas. É monocistrónico, polo que leva a información para sintetizar unha única proteína.
- Procariota: non adopta a estrutura eucariota nin ten intróns; pode ser policistrónico (dúas ou máis cadeas).
ARN de transferencia (ARNt)
Moléculas pequenas, dispersas no citoplasma. A súa función é transportar os aminoácidos ata os ribosomas, onde se sintetizan as proteínas. Conteñen bases metiladas.
Estrutura: presenta unha estrutura tridimensional en forma de L, no plano semellante a unha folla de trevo.
- No extremo 5′ hai un triplete de bases nitroxenadas con guanina e un grupo fosfato libre.
- No extremo 3′ hai unha secuencia CCA sen aparear, onde se une o aminoácido.
ARN ribosómico (ARNr)
É o máis abundante. Ten catro bases nitroxenadas principais, algunhas metiladas, e segmentos monocatenarios en dobre hélice. Está unido a proteínas básicas e forma os ribosomas.
ARN nucleolar
Unido a proteínas, forma o nucléolo. Orixínase a partir de segmentos do ADN denominados rexión organizadora nucleolar (RON); a partir deles fragméntase e prodúcense os distintos tipos de ARN.
ARN pequeno nucleolar
Moi pequeno; únese a proteínas do núcleo formando ribonucleoproteínas pequenas nucleares, que eliminan os intróns.
ARN de interferencia
Actúa como mecanismo de autocontrol da célula, degradando o ARN para que non se sintetice proteína.
Outros tipos
- Ribozimas: ARN con actividade catalítica, que rompen enlaces fosfodiéster.
- Ribonucleoproteínas: ARN asociado a proteínas.
- ARN autocatalíticos: capaces de escindirse sen axuda de enzimas.
Outros nucleótidos
Son nucleótidos de interese biolóxico que non forman ácidos nucleicos e que se atopan libres na célula, con funcións enerxéticas, como cofactores e como mediadores na comunicación celular.
- Nucleótidos de adenina: ricos en enerxía, xa que algúns se unen covalentemente a moléculas de ácido fosfórico. O AMP cíclico actúa como mediador en moitos procesos hormonais: transmite e amplifica os sinais hormonais dentro da célula.
- Nucleótidos coenzimas:
- Flavina-nucleótidos: flavina + ribitol = riboflavina (B2). Actúan como coenzimas en reaccións de oxidorreducción.
- Piridín-nucleótidos: dous nucleótidos unidos por un enlace fosfodiéster; nun a base nitroxenada é a nicotinamida e no outro a adenina.
- Coenzima A: formada por ADP, ácido pantoténico (B5) e β-aminoetanol cun grupo tiol terminal. Desempeña a función de transportador de grupos acilo.